
Gasdermin D (GSDMD)是细胞焦亡的关键执行者,但是GSDMD的翻译后修饰对细胞焦亡的调控作用仍待探索。2024年2月,上海学校师福山老师团体在Cell Death& Disease上发表了题为“Crosstalk of HDAC4, PP1, and GSDMD in controlling pyroptosis”的文章。在这项研究中,作者发现GSDMD可以在赖氨酸248残基处发生乙酰化,并且这种乙酰化增强了焦亡。将组蛋白脱乙酰酶 4(HDAC4)确定为负责介导GSDMD脱乙酰化的特异性脱乙酰酶,从而抑制体外和体内的焦亡。GSDMD的去乙酰化会损害其泛素化,从而抑制焦亡。有趣的是,HDAC4的磷酸化作为一种关键的调节机制出现,促进其去乙酰化GSDMD和抑制GSDMD介导焦亡的能力。拜谱微生物为该研究提供LC-MS/MS淀粉酶质谱了解,揭示了一个涉及HDAC4、PP1和GSDMD的复杂调控网络。这些发现为乙酰化、泛素化和磷酸化在焦亡调节中的相互作用提供了有价值的见解,为炎症细胞死亡领域的进一步研究提供了潜在的靶点。
拜谱提供技术:LC-MS/MS球核苷酸谱分折
一、的研究结果显示
01.GSDMD的K248残基的乙酰化调整焦亡
作者通过前期实验发现,GSDMD的乙酰化促进细胞焦亡。为了确定GSDMD中潜在的乙酰化位点,作者对经过TSA处理的HEK293T细胞中获得的Flag-GSDMD进行了质谱数据分析,并使用软件预测赖氨酸修饰位点。结果发现四种潜在的赖氨酸残基:K103、K145、K248和K387。序列比较发现,Lys103、Lys145和Lys248是GSDMD同源物中保守的乙酰化基序。因此,作者基于GSDMD全长或GSDMD-p30构建了几个突变体(K103R,K145R,K248R和K387R)。结果表明,赖氨酸248在GSDMD中作为乙酰化位点起着关键作用(图1A-D)。此外,GSDMD-KO THP-1细胞中GSDMD-K248R的重建导致的细胞死亡比GSDMD-WT更轻(图1E-F)。此外,作者还开发了GSDMD的结构模型,其乙酰基连接到K248残基上(图1G)。免疫荧光分析表明,与GSDMD-WT相比,GSDMD-K248R不影响其定位(图1H)。因此,这些发现表明Lys248是乙酰化最关键的残基之一。
图1| GSDMD在赖氨酸248处情况乙酰化(图源:Xu W., et al., Cell Death Dis., 20
02.HDAC4治理和改善GSDMD介导的焦亡
如前所述,GSDMD的乙酰化在TSA处理时显著增加,表明了HDAC家族脱乙酰酶的参与。为了鉴定GSDMD的特异性脱乙酰酶,作者对有或没有TSA处理的标记GSDMD进行了质谱阐述,该分析表明HDAC4为GSDMD的特异性脱乙酰酶(图2A)。免疫共沉淀分析证实了GSDMD和HDAC4在HEK293T细胞中存在显著相互作用(图2B),作者还在THP-1细胞中以及猪和小鼠中观察到这种相互作用(图2C)。作者进一步研究了HDAC4对不同物种GSDMD诱导的焦亡的影响。结果表明,HDAC4显著抑制了来自不同物种的GSDMD诱导的焦亡(图2F),此外作者在体外实验中也得到了相同的结果。
图2| HDAC4可抑制体细胞焦亡(图源:Xu W., et al., Cell Death Dis., 2024)
03.蛋白质磷酸酶1(PP1)调节器HDAC4的磷碱化
作著顺利按照实验所室性Ser 246、Ser 467和Ser 632这四个磷过酸位点对HDAC4的去乙酰化活性酶严重要。犹豫HDAC4的磷过酸与此去乙酰化水平有关,且有资料宣传报道淀粉酶磷酸酶1(PP1)复杂控制GSDMD磷过酸并促使焦亡。由于HDAC4也促使细胞膜焦亡,作著统计假设PP1与HDAC4互相用途。结杲确认HDAC4真的与PP1互相用途,如此于它与GSDMD的互相用途。接下来作著顺利按照PP1促使剂冈田酸(OA)除理实验所室性并且 转染实验所室性发现了PP1顺利按照使HDAC4去磷过酸组织GSDMD脱乙酰化的的过程 。 笔者继而浅议了GSDMD的乙酰化和泛素化间的相关。经过TSA补救、HDAC4转染工作及创设乙酰化虚拟突变性体感觉GSDMD的乙酰化增进了其泛素化,这反回来又增进了GSDMD介导的癌细胞焦亡,乙酰化和泛素化在可以调准GSDMD作用这方面来源于可以调准串扰。二、 拜谱总结
在这项研究中,研究团队揭示了一种以前未知的GSDMD翻译后修饰,并阐明了GSDMD、HDAC4和PP1在焦亡调节中的新相互作用。GSDMD和HDAC4的翻译后修饰(泛素化、乙酰化和磷酸化),在调节焦亡中起着至关重要的作用。不同PTM之间的相互作用以及HDAC4和PP1的参与增加了焦亡调节的复杂性,并进一步加深了我们对这一重要生物过程的理解。这些发现为细胞焦亡的机制提供了见解,并为干预炎症相关疾病提供了机会。这一过程中拜谱生物技术提供了LC-MS/MS蛋白酶质谱介绍,拜谱生物可提供完善成熟的蛋白组学、修饰蛋白质组学、代谢组学等多组学产品技术服务,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
学习文章:Xu W, Jin Q, Li X, Li D, Fu X, Chen N, Lv Q, Shi Y, He S, Dong L, Yang Y, Yan Y, Shi F. Crosstalk of HDAC4, PP1, and GSDMD in controlling pyroptosis. Cell Death Dis. 2024 Feb 7;15(2):115. doi: 10.1038/s41419-024-06505-z.