
2024年9月由扬州农林牧大家张万刚博士生导师团体在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物制品为该研究提供了亚硝基化修饰语组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
英文版宝贝标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
杂志期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2025年会影响分子:5.7
发稿时期:2024年9月
客人企业单位:南京农业大学
调查建材:蛋白
拜谱带来了能力:亚硝基化修饰组学
水平的路线:
一、科研毕竟
01.Caspase-3几丁质酶
现有尚不明了NO对caspase-3的抑制性能力是归因于NO介导的S-亚硝基化,不相同氧化还原电位等度的GSNO当作外源性NO产生,以引诱caspase-3的身体S-亚硝基化。結果是因为,与就没有GSNO的组相对来说,100、200和400μM GSNO组的caspase-3几丁质酶同质性较低(图1),与原本新闻报导统一。GSNO处置较低caspase-3几丁质酶的隐藏因为仍亟待具体分析。
图1 与众不同有机废气浓度的GSNO办理对caspase-3活性氧的直接影响
02.Caspase-3的S-亚硝基化成度
钻研Caspase-3的亚硝基化层面,以阐释GSNO对Caspase-3的反响性。经GSNO净化处理后,的检则到caspase-3球蛋白S-亚硝基化难度增长(图2)。这一些后果得出结论,外源性GSNO培养出可成功失败诱骗caspase-3的离体S-亚硝基化。真让人惊叹的是,在不会GSNO会有的對照组中的检则到的较弱的S-亚硝基化带,这得出结论caspase-3应该有内源性的S-亚硝基化。除外,本钻研中caspase-3的S-亚硝基化层面较高,而caspase-3的活性氧较低,这与开始之前的钻研完全一致。既使,caspase-3的特女性朋友S-亚硝基化修饰语位点尚不非常清楚,还需要进这一步的科学探索。
图2 GSNO治疗对caspase-3S-亚硝基化水平面的的影响
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化绘制组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。天蓝色标签的字段说道S-亚硝基化肽,黄色标签的C说道S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱分析
04.S-亚硝基化Caspase-3溶解结核蛋白
结蛋清成为一类非常重要的的癌内部骨架蛋清,在保护肌癌内部架构的架构完全性和紧缩性的方面起着非常重要的反应,学习S-亚硝基化caspase-3对结蛋清可光降解的明感性认识兼有非常重要的目的。与Std(未用胱天蛋清酶-3和GSNO孵育的开始肌玻纤蛋清)组想必,0 μM GSNO组(肌原玻纤和caspase-3的孵育,无GSNO)的完全结蛋清水分成分不错减小,反映caspase-3对结蛋清兼有不确定性的蛋清电离技能。在GSNO孵育后,完全结蛋清的水分成分强烈不断增加(P < 0.05)。显然,当GSNO纯度提高时,完全结蛋清的水分成分继续上涨(P < 0.05)(图5)。这一项发展反映,SNO装饰的caspase-3以关卡信任的具体方法缓和结蛋清的可光降解。
图5.S-亚硝基化caspase-3挥发结核蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3降解塑料肌钙蛋白质-T
肌钙核淀粉酶-T (TnT)是原肌球核淀粉酶调担任肌群缩水的细细的的有必须肌原弹性玻璃化学纤维核淀粉酶。TnT的挥发表现形式是探测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化必要条件下,caspase-3对TnT的挥发的情况如图甲下图6下图,与Std组(不包含caspase-3和GSNO的肌原弹性玻璃化学纤维)较之,caspase-3组中30 kDa TnT段落有效增多,体现了caspase-3参与到了TnT的挥发,除此之外,caspase-3与GSNO的孵育导至30 kDa TnT减退。在100和200 μM GSNO组中间不会有探测到比较突出的文化差异(P > 0.05),而当GSNO的盐浓度可达到400 μM 时,该段落有效限制(P < 0.05)。这发掘体现了了SNO呈现的caspase-3对TnT挥发的可抑制成用。结核淀粉酶和TnT是caspase-3的明感底物,而GSNO正确处理的后果caspase-3的催化渗透性能够导至肌原弹性玻璃化学纤维核淀粉酶挥发水平的后果。总而言之所讲,NO引诱的S-亚硝基化可以根据呈现半胱氨酸残基来调caspase-3的催化渗透性,而使进一歩的后果其对结核淀粉酶和TnT的核淀粉酶电离性能,然而的后果鸡肉产品。
图6. S-亚硝基化caspase- 3降解塑料肌钙核蛋白-T
二、总结
本的研究意在浅谈S-亚硝基化对caspase-3淡化的不良损害基本很快对牛羊肉肌原合成氯纶身体降解塑料的不良损害。血清S-亚硝基化可不可以淡化caspase-3的半胱氨酸残基,最终得以导致caspase-3吸附性缩减,进一大步缓和了其对牛羊肉肌原合成氯纶血清的血清水解反应水平。三、拜谱工作小结
设计用了酶活探测法,亚硝基化淡化组学具体分析,WB等探测行为,会发现血清S-亚硝基化就可以淡化caspase-3的半胱氨酸残基,这引起了caspase-3活性氧的有效降低,并举一部减缓了其对牛羊肉肌原纤维材料血清的血清水解反应本事。本设计为解读血清质亚硝基化对肉质地的调节管控考核机制提供数据没事个新的焦距。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的胆固醇质组学、掩盖胆固醇质组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系统类产品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺硝化作用、total脱色展现、解离巯基,欢迎大家咨询!
决定性专著:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663