
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物工程 为其提供 TMT蛋白酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探究没想到
钻研人士科学探究根据保温时候廷长鸡肉的坚硬程度、持来说水力、光滑、徘徊铁含锌量、ROS、脂质过硫化物、MDA、GSH和GPX4质量来风险评估腿部肌肉组建肿瘤受损细胞的铁自杀阶段。结果显视显视,保温时候廷长后,鸡肉的坚硬程度在第六天和第6天为正相关减退;持水特性大大减少;彩色变深,失光滑,鲜红白色转换成暗红白色。不仅,徘徊铁、特异性氧和MDA的含锌量为正相关加强,肿瘤受损细胞凋亡率为正相关增高。 研究探讨工人提炼有能力差异聊天 冷冻时光的肌土样的胆固醇质,接着对其进行SDS-PAGE分享,胆固醇质条带在有能力差异聊天 年间区域划分透亮且是类似的(图1a)。按照胆固醇在有能力差异聊天 土样中的传达原因,分享察觉同时组土样的中四位数非常接近于同时总体水平(图1b),阐述肌土样胆固醇质具有着不错的组内是类似的性和组间能力差异聊天性。 营养素质组学共判定出1996种营养素质。以B0为比组,淘汰B1、B2、B4和B6中的营养素去性别对比分析表示出来分折,共判定到374个DEPs。将火山图可视化效果,并会根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两种标准化分折DEP。没想到如图甲随时1c-f随时,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别判定出22、33、73和140个DEPs,这之中分头别上浮6、11、32和87个,上涨16、22、41和5俩个。聚类分析方案估评了其他冷冻冷藏的阶段肩部全身肌肉机构中营养素质的表示出来,没想到展现肩部全身肌肉营养素表示出来性别对比分析随着用时的推移保管用时的扩大而扩大(图1g)。
图1| 不一冷库耗时的背部肌肉印刷品淀粉酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各种不同保鲜期限的脂肪样本区别球蛋白分享(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁生亡球蛋白肽的PRM化学发光法深入分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 体系结构KEGG丰度性别差异呈现球蛋白的铁突然死亡逻辑(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱海洋生物提供了TMT按量蛋清质组学技巧工艺服务性培训,拜谱生物学已新物料开发实现并搭建了更加完善成长期的转录组学、蛋清组学、排泄组学及其两组学协同物料技巧工艺服务性培训风险管理体系,欢迎致电咨询!
考虑论文资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.